Piri Reis Üniversitesi Deniz Ticaret Odası destekli bir üniversitedir. Armatörler (Gemi Sahipleri) tarafından destek görür ve çeşitli burslar verirler. Bu bursları karşılıksız değildir, hizmet karşılığı maaştan kesilerek geri ödemesi yapılmaktadır. Bu durum bazı kişiler için avantaj bazı kişiler için dezavantajlı olabilir. Düşük maaşa uzun seneler çalışmak gibi.
Vakıf üniversitesi avantajı eğitimin gerektirdiği simulatör vb araç gerecin en kısa zamanda teminini sağlayabilirken devlet okulları prosedürleri gereği biraz daha geç temin edebiliyorlar.
